要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("derfinderPlot")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

derfinderPlot

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见derfinderPlot

derfinder的绘图函数

Bioconductor版本:3.1

derfinder的绘图函数

作者:莱昂纳多·科拉多-托雷斯[aut, cre],安德鲁·e·贾菲[aut],杰弗里·t·莱克[aut, ths]

维护者:Leonardo Collado-Torres

引用(从R中,输入引用(“derfinderPlot”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("derfinderPlot")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“derfinderPlot”)

超文本标记语言 R脚本 derfinderPlot介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionRNASeq测序软件可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor公司 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.2)
进口 derfinder(> = 1.1.0版),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeaturesGenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2IRanges(> = 1.99.28),plyrRColorBrewerreshape2尺度
链接
建议 biovizBasebumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),devtools(> = 1.6),knitcitations(> = 1.0.1),knitr(> = 1.6),knitrBootstrap(> = 0.9.0),org.Hs.eg.dbrmarkdown(> = 0.3.3),testthatTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lcolladotor/derfinderPlot
BugReports https://github.com/lcolladotor/derfinderPlot/issues
全靠我
进口我 regionReport
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 derfinderPlot_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 derfinderPlot_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) derfinderPlot_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) derfinderPlot_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/derfinderPlot/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/derfinderPlot/
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