要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("derfinderPlot")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见derfinderPlot.
Bioconductor版本:3.1
derfinder的绘图函数
作者:莱昂纳多·科拉多-托雷斯[aut, cre],安德鲁·e·贾菲[aut],杰弗里·t·莱克[aut, ths]
维护者:Leonardo Collado-Torres
引用(从R中,输入引用(“derfinderPlot”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("derfinderPlot")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“derfinderPlot”)
超文本标记语言 | R脚本 | derfinderPlot介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,RNASeq,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.2) |
进口 | derfinder(> = 1.1.0版),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2,IRanges(> = 1.99.28),plyr,RColorBrewer,reshape2,尺度 |
链接 | |
建议 | biovizBase,bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),devtools(> = 1.6),knitcitations(> = 1.0.1),knitr(> = 1.6),knitrBootstrap(> = 0.9.0),org.Hs.eg.db,rmarkdown(> = 0.3.3),testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lcolladotor/derfinderPlot |
BugReports | https://github.com/lcolladotor/derfinderPlot/issues |
全靠我 | |
进口我 | regionReport |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | derfinderPlot_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | derfinderPlot_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | derfinderPlot_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | derfinderPlot_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/derfinderPlot/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/derfinderPlot/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: