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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见gdsfmt．

CoreArray基因组数据结构(GDS)文件的R接口

Bioconductor版本:3.1

该包为CoreArray基因组数据结构(GDS)数据文件提供了高级R接口，这些数据文件跨平台可移植，并包括层次结构，以存储多个具有元数据信息的可伸缩的面向数组的数据集。它适用于大规模数据集，特别是那些比可用的随机访问内存大得多的数据。gdsfmt包提供了专门为小于8位的整数设计的高效操作，因为单个遗传/基因组变体，如单核苷酸多态性(SNP)，通常占用的比特数少于一个字节。数据压缩和解压也支持相对有效的随机访问。允许与包并行支持的多个R进程并行读取一个GDS文件。

作者:郑秀文[aut, cre]， Stephanie Gogarten [ctb]， Jean-loup Gailly和Mark Adler [ctb](包括zlib来源)，Yann Collet [ctb](包括LZ4来源)

维护者:郑秀文

安装

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文档

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browseVignettes(“gdsfmt”)

超文本标记语言	R脚本	CoreArray基因组数据结构(GDS)文件的R接口
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 2.14.0)
进口	方法
链接
建议	平行,RUnit，knitr，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	http://corearray.sourceforge.net/http://github.com/zhengxwen/gdsfmt
BugReports	http://github.com/zhengxwen/gdsfmt/issues
全靠我	SeqArray，SNPRelate
进口我	GWASTools，SeqVarTools
建议我	《创世纪》，HIBAG
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	gdsfmt_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	gdsfmt_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	gdsfmt_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	gdsfmt_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/gdsfmt/tree/release-3.1
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gdsfmt/
软件包下载报告	下载数据