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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mvGST。

多元和定向基因测试

Bioconductor版本:3.1

mvGST提供独立于平台的工具来识别项(基因集),不同活跃(向上或向下)在多个感兴趣的对比。给定矩阵的片面的假定值(行基因,列对比),mvGST使用整合方法结合假定值对所有基因注释每个基因集,然后每个基因集划分为(1)更活跃,不活跃(1),或不显著差异活动(0)在每个感兴趣的对比。与多个感兴趣的对比,每个基因集分配给一个概要文件(在对比)的微分活动。工具也提供了可视化(图形)基因分类设置为给定的概要文件。

作者:约翰·r·史蒂文斯和丹尼斯·s·Mecham

维修工:约翰·r·史蒂文斯< john.r。史蒂文斯在usu.edu >

安装

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文档

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PDF	R脚本	mvGST教程装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,去,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,OneChannel,通路,RNASeq,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0),GO.db,Rgraphviz
进口	gProfileR,stringr,topGO,GOstats,注释,AnnotationDbi,图
链接
建议	hgu133plus2.db,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	mvGST_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	mvGST_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	mvGST_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	mvGST_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/mvgst/tree/release - 3.1
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mvGST/
包下载报告	下载数据