要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“sapFinder”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

sapFinder

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见sapFinder

鸟枪蛋白质组学中变异肽检测和可视化的软件包。

Bioconductor版本:3.1

sapFinder开发用于自动化(1)变体相关数据库构建,(2)数据库搜索,(3)后处理,(4)基于html的霰弹枪蛋白质组学报告生成。

作者:徐少航,文博

维护者:Shaohang Xu ,博文<文博在基因组网>

引文(从R内,输入引用(“sapFinder”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“sapFinder”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“sapFinder”)

PDF R脚本 sapFinder装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews MassSpectrometry蛋白质组学RNASeqReportWriting单核苷酸多态性软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.0.0),rTANDEM(> = 1.3.5)
进口 pheatmapRcpp(>= 0.10.6),图形,grDevices, stats, utils
链接 Rcpp
建议 RUnitBiocGenericsBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 sapFinder_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 sapFinder_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) sapFinder_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) sapFinder_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/sapFinder/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/sapFinder/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心