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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅SAPS。

预后特征的显着性分析

生物导体版本：3.1

实施预后特征方法（SAPS）的显着性分析的功能。SAPS提供了一种可靠的方法来识别与患者生存相关的生物学上重要的基因集。计算三个基本统计数据。首先，根据候选基因集的差异表达，将患者聚集在两个生存组中。P_PURE被计算为两组之间无生存差异的概率。接下来，将相同的过程应用于随机生成的基因集，并且P_random被计算为获得与候选基因集一样显着的P_PURE的比例。最后，通过对一致性指数对所有基因进行排名，并计算出P_enrich来指示候选基因集富含单变量预后意义的基因的程度，以指示p_enrich的程度。计算一个SAPS_SCORE来汇总这三个统计信息，并且可以选择计算Q值来估计SAPS_SCORE的重要性，通过计算随机基因集的SAPS_SCORE。

作者：Daniel Schmolze [AUT，CRE]，Andrew Beck [Aut]，Benjamin Haibe-kains [aut]

维护者：daniel schmolze

安装

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文档

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Browsevignettes（“ SAPS”）

html	R脚本	SAPS小插图
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	生物医学信息学，，，，差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，软件，，，，生存
版本	2.0.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（1年）
执照	麻省理工学院 +文件许可证
要看	r（> = 2.14.0），生存
进口	钢琴，，，，survomp，，，，RESHAPE2
链接
建议	降雪，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	saps_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	saps_2.0.0.zip
Mac OS X 10.6（雪豹）	saps_2.0.0.tgz
Mac OS X 10.9（Mavericks）	saps_2.0.0.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/saps/tree/release-3.1
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/saps/
软件包下载报告	下载统计