要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ splicer”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

拼接器

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅拼接器

从RNA-seq数据中分类替代剪接和编码潜力的预测。

生物导体版本:3.1

用于分类的替代剪接和从RNA-seq数据进行编码潜力预测的R软件包。

作者:johannes waage ,kristoffer vitting-seerup

维护者:johannes waage ,kristoffer vitting-seerup

引用(从r内,输入引用(“拼接”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ splicer”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“拼接”)

PDF R脚本 拼接数小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.15.0),方法,腹带,,,,rtracklayer,,,,Venndiagram,,,,rcolorbrewer,,,,plyr
进口 基因组机,,,,iranges
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,BSGENOME
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Splicer_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 Splicer_1.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) Splicer_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) Splicer_1.10.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/splicer/tree/release-3.1
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/splicer/
软件包下载报告 下载统计

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请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

弗雷德·哈钦森癌症研究中心