要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ airway”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅呼吸道。
生物导体版本:3.1
该软件包提供了一个概述的读数对基因中读数的对象,用于在四个用地塞米松处理的人类气道平滑肌细胞系上进行的RNA-Seq实验。包装插图中提供了有关基因模型和读取过程的详细信息。实验的引用是:Himes Be,江内X,瓦格纳P,Hu R,Wang Q,Klanderman B,Whitaker RM,Duan Q,Lasky-Su J,Nikolos C,Jester C,Jester W,Johnson M,Johnson M,Panettieri R JR,Tantisira,Tantisira,Tantisira,TantisiraKG,Weiss St,Lu Q.'RNA-Seq转录组分析表将CRISPLD2鉴定为一种糖皮质激素反应性基因,可调节气道平滑肌细胞中的细胞因子功能。PLOS ONE。2014年6月13日; 9(6):E99625。PMID:24926665。GEO:GSE52778。
作者:迈克尔·洛夫
维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)
引用(从r内,输入引用(“气道”)
):
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Browsevignettes(“气道”)
html | R脚本 | 气道平滑肌细胞 |
参考手册 |
生物浏览 | 实验数据,,,,地理,,,,rnaseqdata,,,,序列数据 |
版本 | 0.102.0 |
执照 | LGPL |
要看 | r(> = 2.10),基因组机 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,地球 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | deseq2,,,,富集兄弟 |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | airway_0.102.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/airway/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |