要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ airway”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

呼吸道

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅呼吸道

Himes等

生物导体版本:3.1

该软件包提供了一个概述的读数对基因中读数的对象,用于在四个用地塞米松处理的人类气道平滑肌细胞系上进行的RNA-Seq实验。包装插图中提供了有关基因模型和读取过程的详细信息。实验的引用是:Himes Be,江内X,瓦格纳P,Hu R,Wang Q,Klanderman B,Whitaker RM,Duan Q,Lasky-Su J,Nikolos C,Jester C,Jester W,Johnson M,Johnson M,Panettieri R JR,Tantisira,Tantisira,Tantisira,TantisiraKG,Weiss St,Lu Q.'RNA-Seq转录组分析表将CRISPLD2鉴定为一种糖皮质激素反应性基因,可调节气道平滑肌细胞中的细胞因子功能。PLOS ONE。2014年6月13日; 9(6):E99625。PMID:24926665。GEO:GSE52778。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“气道”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ airway”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“气道”)

html R脚本 气道平滑肌细胞
PDF 参考手册

细节

生物浏览 实验数据,,,,地理,,,,rnaseqdata,,,,序列数据
版本 0.102.0
执照 LGPL
要看 r(> = 2.10),基因组机
进口
链接
建议 尼特,,,,地球
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 deseq2,,,,富集兄弟
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 airway_0.102.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/airway/
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