分配
DOI:10.18129 / B9.bioc.ASSIGN
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分配。
自适应特征选择和集成(分配)
Bioconductor版本:3.10
分配是一个计算工具来评估途径放松管制/激活状态在单独的患者样本。分配了一个灵活的贝叶斯因子分析方法,适应预定路径签名从文学知识或来自扰动实验细胞/组织途径签名。放松管制/每个上下文相关的通路激活水平的量化分数,代表病人样本的程度包括途径放松管制/激活签名。
《图片报》作者:应沈,安德里亚·h·w·埃文约翰逊和Mumtehena拉赫曼
维护者:< yshen3 bu.edu >应慎重,w·埃文约翰逊< wej bu.edu >,大卫·詹金斯dfj bu.edu > < <清楚moomba Mumtehena拉赫曼。拉赫曼在utah.edu >
从内部引用(R,回车引用(“转让”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“转让”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“转让”)
| HTML | R脚本 | 底漆 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 贝叶斯,GeneExpression,通路,软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(6年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | gplots、图形、grDevices二甲基砜,Rlab统计数据,股东价值分析跑龙套,ggplot2,yaml |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,BiocStyle,lintr,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://compbiomed.github.io/ASSIGN/ |
| BugReports | https://github.com/compbiomed/ASSIGN/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ASSIGN_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ASSIGN_1.22.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ASSIGN_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASSIGN |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/分配 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ASSIGN/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
