ArrayExpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpress

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ArrayExpress

在EBI访问ArrayExpress Microarray数据库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

Bioconductor版本:3.10

访问EBI的ArrayExpress存储库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

作者:奥黛丽·考夫曼,易卜拉欣·伊玛姆,迈克尔·舒伯特

维护者:Suhaib Mohammed < Suhaib at ebi.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“ArrayExpress”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ArrayExpress”)

PDF R脚本 ArrayExpress:将ArrayExpress数据集导入并转换为R对象
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport微阵列OneChannel软件TwoChannel
版本 1.46.0
在Bioconductor BioC 2.3 (R-2.8)(11.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.9.0),Biobase(> =测试盒框)
进口 XML益生元limma
链接
建议 affy
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 DrugVsDiseasemaEndToEnd
进口我
建议我 gCMAPWebHiiragi2013
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 ArrayExpress_1.46.0.tar.gz
Windows二进制 ArrayExpress_1.46.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) ArrayExpress_1.46.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpress
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ArrayExpress
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ArrayExpress/
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