此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅arrayexpresshts。
生物导体版本:3.10
用于公共阵列Express实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道
作者:安吉拉·冈卡维斯(Angela Goncalves),安德鲁·蒂科诺夫(Andrew Tikhonov)
维护者:Angela Goncalves
引用(从r内,输入引用(“ arrayexpresshts”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ arrayexpresshts”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ arrayexpresshts”)
R脚本 | ArrayExpresshts:用于转录分析实验的RNA-SEQ管道 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(9年) |
执照 | 艺术许可2.0 |
要看 | 采样,,,,rsamtools(> = 1.99.0),雪 |
进口 | 生物酶,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,deseq,,,,基因组机,,,,HMISC,,,,iranges(> = 2.13.11),R2HTML,,,,rcolorbrewer,,,,rsamtools,,,,Shortread,,,,XML,,,,Biomart,,,,EDGER,grdevices,图形,方法,rjava,统计SVMISC,utils,sendmailr,,,,比特 |
链接 | Rhtslib(> = 1.15.3) |
建议 | |
系统要求 | gnu做 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | arrayexpresshts_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | arrayexpresshts_1.36.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayexpresshts |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/arrayexpresshts |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/arrayexpresshts/ |
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