BDMMACORCT
doi：10.18129/b9.bioc.bdmmacorect
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅BDMMACORCT。
元基因组读数计数来自不同队列的数据的荟萃分析
生物导体版本：3.10
宏基因组测序技术可以对微生物组进行定量分析。但是，由于实验之间的变化，将这些实验中的微生物数据组合起来是具有挑战性的。校正批处理效应的现有方法没有考虑变量之间的相互作用（微生物研究中的菌群分类单元）和微生物组数据的过度分散。因此，它们不适用于微生物组数据。我们开发了一种新方法，即贝叶斯迪里奇 - 灌注回归荟萃分析（BDMMA），以同时对批处理效应进行建模并检测与表型相关的微生物类群。BDMMA会自动建模微生物分类单元之间的依赖性，并且对微生物组及其关联稀疏性的高维度具有鲁棒性。
作者：zhenwei dai
维护者：zhenwei dai
引用（从r内，输入引用（“ BDMMACORCT”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bdmmacorect”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ bdmmacorect”）
| R脚本 | BDMMACORRECT_USER_GUIDE | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，贝叶斯，，，，免疫学，，，，微生物组，，，，软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.5），素食主义者，，，，椭圆，，，，GGPLOT2，，，，猿，，，，总结性特征 |
| 进口 | RCPP（> = 0.12.12），rcpparmadillo，，，，rcppeigen，统计 |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo，，，，rcppeigen |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | bdmmacorrect_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bdmmAcorrect_1.4.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | bdmmAcorrect_1.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bdmmacorect |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/bdmmacorect |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bdmmacorrect/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
