Bionet
doi：10.18129/b9.bioc.bionet
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Bionet。
生物网络功能分析的常规
生物导体版本：3.10
该软件包为蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测提供了功能。可以通过将统计测试的p值分配给网络节点来集成到网络中。例如。从Affymetrix阵列的基因的差分表达获得的P值分配给网络节点。通过拟合β-均匀的混合模型并计算来自p值的得分，可以计算网络区域的整体得分，并且整数线性编程算法可以识别最大评分子网络。
作者：Marcus Dittrich和Daniela Beisser
维护者：marcus dittrich
引用（从r内，输入引用（“ Bionet”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bionet”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Bionet”）
| R脚本 | Bionet教程 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，差异性，，，，基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，软件 |
| 版本 | 1.46.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.7（R-2.12）（9。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.10.0），图形，，，，rbgl |
| 进口 | Igraph（> = 1.0.1），AnnotationDbi，，，，生物酶 |
| 链接 | |
| 建议 | RGL，，，，算，，，，DLBCL，，，，GeneFilter，，，，Xtable，，，，全部，，，，林玛，，，，HGU95AV2.DB，，，，XML |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | HTSANALYZER，，，，Smite |
| 建议我 | 圣诞老人 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Bionet_1.46.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bionet_1.46.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Bionet_1.46.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bionet |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/bionet |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bionet/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
