相机

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMERA

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见相机．

质谱数据注释相关方法的收集

Bioconductor版本:3.10

xcms生成的峰表注释，基于规则的同位素和加合物注释，同位素验证，基于EIC相关的未知加合物和碎片标记

作者:Carsten Kuhl, Ralf Tautenhahn, Hendrik Treutler, Steffen Neumann {ckuhl|htreutle|sneumann}@ipb-halle.de, rtautenh@scripps.edu

维护人员:Steffen Neumann

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CAMERA")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“相机”)

PDF		使用compoundQuantiles的原子计数期望
PDF		用CAMERA进行同位素模式验证
PDF	R脚本	用CAMERA进行分子识别
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.42.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 2.1.0)，方法，Biobase，xcms(> = 1.13.5)
进口	方法,xcms，RBGL，图，图形，grDevices, stats, utils，Hmisc，igraph
链接
建议	faahKO，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了	Rmpi，雪
URL	http://msbi.ipb-halle.de/msbi/CAMERA/
BugReports	https://github.com/sneumann/CAMERA/issues/new
取决于我	flagme，首次公开募股，LOBSTAHS，MAIT，metaMS，PtH2O2lipids
进口我
建议我	cliqueMS，msPurity，mtbls2，RMassBank
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CAMERA_1.42.0.tar.gz
Windows二进制	CAMERA_1.42.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CAMERA_1.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAMERA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/相机
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CAMERA/
包下载报告	下载数据