CAMTHC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMTHC

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅一揽子生命结束指南更多信息。

此包适用于Bioconductor的3.10版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见CAMTHC(重命名为debCAM)。

用于组织异质性表征的混合物凸分析

Bioconductor版本:3.10

用混合物凸分析(CAM)描述组织异质性的R包。它提供了CAM对混合表达谱进行无监督反褶积的基本函数和帮助理解子种群特异性结果的辅助函数。它还实现了基于分子标记、S矩阵或A矩阵的先验知识进行监督反褶积的函数。结合来自CAM和先验知识的分子标记可以实现混合物的半监督反褶积。

作者:Lulu Chen

维护人员:Lulu Chen

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CAMTHC")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CAMTHC”)

超文本标记语言	R脚本	CAMTHC用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，GeneExpression，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor公司	BioC 3.8 (R-3.5)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)
进口	方法,rJava，BiocParallel统计数据,Biobase，SummarizedExperiment，corpcor，几何，NMF，nnls，DMwR，pcaPP，apcluster、图形
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，GEOquery，rgl
SystemRequirements	Java (>= 1.8)
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Lululuella/CAMTHC/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CAMTHC_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	CAMTHC_1.4.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CAMTHC_1.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CAMTHC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CAMTHC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CAMTHC/
软件包下载报告	下载数据