此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Ctdquerier。
生物导体版本:3.10
包以检索和可视化来自比较毒物组中的数据库(http://ctdbase.org/)。下载的数据被选为DataFrame,以便进一步下游分析。
作者:Carles Hernandez-Ferrer [Aut,Cre],Jaun R. Gonzalez [Aut]
维护者:Carles Hernandez-Ferrer
引文(从R内,输入引文(“Ctdquerier”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“ctdquerier”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“CTDQUERIER”)
HTML. | r script. | 环境化学品和哮喘相关基因的案例研究 |
HTML. | r script. | ctdquerier:一个包来检索下游分析和数据可视化的CTDBase数据 |
HTML. | r script. | CTDquerier R包和CTDBase Batch查询Web工具的简单比较 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | BioMeDicalInformatics那DataImport.那datarepresentation那去那GenesetenRichment.那基础设施那ke那网络那NetworkenRichment.那途径那软件 |
版本 | 1.5.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 3.7(R-3.5)(2年) |
执照 | mit +文件执照 |
依靠 | r(> = 3.4.0) |
进口 | rcurl.那stringr.那S4Vectors.那string那ggplot2.那iGraph.,ilils,grid,格拉底,方法,统计,biocfilecache.那rappdirs. |
链接到 | |
建议 | 生物焦那kn |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | ctdquerier_1.5.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | ctdquerier_1.5.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | ctdquerier_1.5.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/ctdquerier |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/ CTDquerier |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/ctdquerier/ |
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