Ctdquerier

DOI:10.18129 / b9.bioc.ctdquerier

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Ctdquerier

CTDBase数据查询包,可视化和下游分析

生物导体版本:3.10

包以检索和可视化来自比较毒物组中的数据库(http://ctdbase.org/)。下载的数据被选为DataFrame,以便进一步下游分析。

作者:Carles Hernandez-Ferrer [Aut,Cre],Jaun R. Gonzalez [Aut]

维护者:Carles Hernandez-Ferrer

引文(从R内,输入引文(“Ctdquerier”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“ctdquerier”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“CTDQUERIER”)

HTML. r script. 环境化学品和哮喘相关基因的案例研究
HTML. r script. ctdquerier:一个包来检索下游分析和数据可视化的CTDBase数据
HTML. r script. CTDquerier R包和CTDBase Batch查询Web工具的简单比较
PDF. 参考手册
文本 执照

细节

Biocviews. BioMeDicalInformaticsDataImport.datarepresentationGenesetenRichment.基础设施ke网络NetworkenRichment.途径软件
版本 1.5.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.7(R-3.5)(2年)
执照 mit +文件执照
依靠 r(> = 3.4.0)
进口 rcurl.stringr.S4Vectors.stringggplot2.iGraph.,ilils,grid,格拉底,方法,统计,biocfilecache.rappdirs.
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包档案包

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源包 ctdquerier_1.5.0.tar.gz.
Windows二进制文件 ctdquerier_1.5.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) ctdquerier_1.5.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/ctdquerier
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ CTDquerier
包短网址 https://biocumon.org/packages/ctdquerier/
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