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- Biocumon 3.10
- 软件包
- CVE.
CVE.
DOI：10.18129 / b9.bioc.cve.
此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅CVE.。
癌症变异探险家
生物导体版本：3.10
闪亮应用程序在精密肿瘤学中交互式变体优先级。CVE的输入文件是最近发布的onCotator变型注释工具的输出文件，总结了来自对癌症研究相关的14个不同公共资源的变体信息。CVE中的互动性序列基于已知的种系和癌症变体，DNA修复基因和功能预测分数。CVE的可选特征是探讨使用从公开的转录组数据产生的共表达模块促进的肿瘤特异性途径上下文。使用药物基因相互作用数据库（DGIDB）评估优先级变体的可耐药性。
作者：Andreas Mock [Aut，CRE]
维护者：Andreas Mock
引文（从R内，输入引文（“CVE”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：
if（！qualocmanage（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cve”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“CVE”）
| HTML. | r script. | 癌症变异探险家（CVE）教程 |
| HTML. | r script. | 具有TCGA RNASEQ数据的加权基因共表达网络分析 |
| PDF. | 参考手册 |
细节
| Biocviews. | BioMeDicalInformatics那软件 |
| 版本 | 1.11.2 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.4（R-3.3）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-3 |
| 依靠 | r（> = 3.4.0），俗苯.那普利尔那ggplot2. |
| 进口 | 闪亮的那共识那rcolorbrewer.那贡献那雅思石那猿那WGCNA那rtcgatoolbox. |
| 链接到 | |
| 建议 | kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那生物焦 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | cve_1.11.2.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | cve_1.11.2.zip. |
| Mac OS x 10.11（El Capitan） | cve_1.11.2.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/cve. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包装/ cve |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/cve/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
