CancerSubtypes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见CancerSubtypes。

基于多个基因组数据集的癌症亚型识别、验证和可视化

Bioconductor版本:3.10

CancerSubtypes整合了目前常见的癌症亚型鉴定计算生物学方法，为基于基因表达、miRNA表达、DNA甲基化等多组学数据的癌症亚型分析提供了标准化框架。

作者:徐涛生<陶生。X在gmail.com>，Thuc Le

维护者:陶生徐<陶生。X在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CancerSubtypes")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“CancerSubtypes”)

超文本标记语言	R脚本	CancerSubtypes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，软件，可视化
版本	1.12.1
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.4)，sigclust，NMF
进口	SNFtool，iCluster，集群，嫁祸于，limma，ConsensusClusterPlusgrDevices,生存
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，knitr，RTCGA.mRNA，RTCGA.clinical
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes
BugReports	https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	CancerSubtypes_1.12.1.tar.gz
Windows二进制	CancerSubtypes_1.12.1.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CancerSubtypes_1.12.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/CancerSubtypes
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CancerSubtypes/
软件包下载报告	下载数据