CellMixS

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellMixS

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CellMixS．

评估细胞特异性混合

Bioconductor版本:3.10

评估scRNA-seq数据中不同批次/组的细胞特异性混合评分(CMS)。

作者:Almut Lütge

维护人员:Almut Lütge < Almut。Luetge在uzh.ch>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CellMixS")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CellMixS”)

超文本标记语言	R脚本	探索数据集成和批处理效果
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，GeneExpression，SingleCell，软件，转录组
版本	1.2.6
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	kSamples， r (>= 3.6)
进口	BiocNeighbors，ggplot2，嘘，冬青，cowplot，SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，tidyr，magrittr，dplyr，ggridges统计数据,purrr，listarrays、方法、BiocParallel，BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，limma
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/almutlue/CellMixS
BugReports	https://github.com/almutlue/CellMixS/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CellMixS_1.2.6.tar.gz
Windows二进制	CellMixS_1.2.6.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CellMixS_1.2.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellMixS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CellMixS
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CellMixS/
软件包下载报告	下载数据