chipqc
doi：10.18129/b9.bioc.chipqc
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅chipqc。
chipseq数据的质量指标
生物导体版本：3.10
chipseq数据的质量指标。
作者：汤姆·卡罗尔（Tom Carroll），韦·刘（Wei Liu）
维护者：tom carroll
引用（从r内，输入引用（“ chipqc”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ chipqc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ chipqc”）
| R脚本 | 用CHIPQ评估ChIP-Seq样品质量 | |
| chipqcsamplereport.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，QualityControl，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（6年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | r（> = 3.0.0），GGPLOT2，，，，差异，，，，基因组机（> = 1.17.19） |
| 进口 | 生物基因（> = 0.11.3），S4VECTORS（> = 0.1.0），iranges（> = 1.99.17），rsamtools（> = 1.17.28），基因组签名（> = 1.1.16），chipseq（> = 1.12.0），gtools，，，，生物比较， 方法，RESHAPE2，，，，喷嘴.r1，，，，生物酶，grdevices，统计，utils，GenomicFeatures，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9，，，，txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene，，，，txdb.celegans.ucsc.ce6.ensgene，，，，txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | chipqc_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | chipqc_1.22.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | chipqc_1.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipqc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/chipqc |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/chipqc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
