芝加哥
doi：10.18129/b9.bioc.Chicago
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅芝加哥。
芝加哥：捕获基因组组织的HI-C分析
生物导体版本：3.10
用于分析捕获HI-C数据的管道。
作者：乔纳森·凯恩斯（Jonathan Cairns），宝拉·弗里雷·普里切特（Paula Freire Pritchett），史蒂文·温特（Steven Wingett），米哈伊尔·斯皮瓦科夫
维护者：Mikhail Spivakov
引用（从r内，输入引用（“芝加哥”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“芝加哥”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“芝加哥”）
| html | R脚本 | 芝加哥小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 表观遗传学，，，，嗝，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.2），Data.Table |
| 进口 | 矩阵，，，，大量的，，，，HMISC，，，，Delaporte，方法，grdevices，图形，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | Argparser，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，pchicdata，，，，测试，，，，rsamtools，，，，基因组间，，，，基因组机，，，，iranges，，，，AnnotationHub |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | pchicdata |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | 芝加哥1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | 芝加哥1.14.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | 芝加哥1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chicago |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/芝加哥 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/chicago/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
