这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ComplexHeatmap。
Bioconductor版本:3.10
复杂的热图是有效的可视化不同来源的数据集之间的联系,揭示潜在的模式。这里ComplexHeatmap包提供了一个高度灵活的方式安排多个热图和支持各种注释图形。
作者:Zuguang顾
维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“ComplexHeatmap”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ComplexHeatmap”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ComplexHeatmap”)
HTML | complex_heatmap.html | |
HTML | R脚本 | 最可能问的问题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 测序,软件,可视化 |
版本 | 2.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R(> = 3.1.2)、方法、网格,图形,统计,grDevices |
进口 | circlize(> = 0.4.5),GetoptLong,色彩,线索,RColorBrewer,GlobalOptions(> = 0.1.0),平行,png |
链接 | |
建议 | testthat(> = 1.0.0),knitr,减价,dendsort,开罗,jpeg,tiff,fastcluster,dendextend(> = 1.0.1),grImport,grImport2,胶水,GenomicRanges |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ |
取决于我 | 意大利苦杏酒,EnrichedHeatmap,收回 |
进口我 | artMS,BiocOncoTK,blacksheepr,催化剂,可可,可乐,DEComplexDisease,DEGreport,部,diffcyt,埃尔默,EnrichmentBrowser,fCCAC,ImpulseDE2,LineagePulse,马斯喀特,MWASTools,PathoStat,profileplyr,SEtools,singleCellTK,TCGAWorkflow,Xeva,YAPSA |
建议我 | 阿尔卑斯山脉,gtrellis,HilbertCurve,projectR,TCGAbiolinks,TCGAutils,TimeSeriesExperiment |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ComplexHeatmap_2.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | ComplexHeatmap_2.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ComplexHeatmap_2.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ComplexHeatmap |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ComplexHeatmap/ |
包下载报告 | 下载数据 |