科尔特
doi：10.18129/b9.bioc.cormut
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅科尔特。
根据选择压力检测相关突变
生物导体版本：3.10
Cormut提供了计算单个位点或特定氨基酸的KAK的功能，并检测它们之间的相关突变。提供了三种检测相关突变的方法，包括条件选择压力，相互信息和JACCARD指数。该计算由两个步骤组成：首先，检测到阳性选择位点；其次，在正选择位点之间计算突变相关性。请注意，第一步是可选的。同时，Cormut通过相关突变网络的方式促进了两个条件之间的相关突变的比较。参考序列应为序列文件的第一个序列，并且不允许存在间隙。
作者：Zhenpeng li
维护者：zhenpeng li
引用（从r内，输入引用（“ Cormut”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ cormut”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Cormut”）
| R脚本 | 科尔特 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（7。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | 方法，seqinr，，，，Igraph |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cormut_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cormut_1.28.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Cormut_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cormut |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cormut |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cormut/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
