此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅CoverageView。
生物导体版本:3.10
该软件包为可视化基因组覆盖率概况提供了一个框架。它可用于芯片seq实验,但也可用于全基因组核小体定位实验或其他实验类型,在这些实验类型中,要有一个框架以检查覆盖范围如何分布在基因组中很重要。
作者:Ernesto Lowy
维护者:ernesto lowy
引用(从r内,输入引用(“ CoverageView”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ coverageView”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ CoverageView”)
R脚本 | 易于可视化阅读覆盖范围 | |
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,技术,,,,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(6年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 2.10),方法,rsamtools(> = 1.19.17),rtracklayer |
进口 | S4VECTORS(> = 0.7.21),iranges(> = 2.3.23),基因组机,,,,基因组签名,并行,工具 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | CoverageView_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | CoverageView_1.24.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coverageview |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/coverageView |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/coverageview/ |
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