CrossICC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CrossICC

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CrossICC．

面向多平台数据分析的交互式共识聚类框架

Bioconductor版本:3.10

CrossICC采用迭代策略，从共识聚类生成的共识相似矩阵中得到最优基因集和簇数，能够处理多个跨平台数据集，不需要数据集之间的归一化。该软件包还提供了丰富的可视化和识别癌症亚型的功能。特别是，许多癌症相关的分析方法被嵌入，以促进已确定的癌症亚型的临床翻译。

作者:孙宇[aut, cre]，赵琦[aut]

维护人员:孙宇

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CrossICC")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CrossICC”)

超文本标记语言	R脚本	如何使用CrossICC?
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，分类，聚类，DifferentialExpression，FeatureExtraction，GUI，GeneExpression，GeneSetEnrichment，微阵列，归一化，预处理，RNASeq，软件，生存，可视化
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (>= 3.5)，质量
进口	data.table、方法、MergeMaid，ConsensusClusterPlus，limma，集群，dplyr，Biobase， grDevices，统计，图形，utils
链接
建议	rmarkdown，testthat，knitr，闪亮的，shinydashboard，shinyWidgets，shinycssloaders，DT，ggthemes，ggplot2，pheatmap，RColorBrewer，宠物猫，ggalluvial
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CrossICC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	CrossICC_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CrossICC_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CrossICC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CrossICC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CrossICC/
软件包下载报告	下载数据