此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAcopy.
Bioconductor版本:3.10
采用循环二进制分割(CBS)算法对DNA拷贝数数据进行分割,识别出拷贝数异常的基因组区域。
作者:Venkatraman E. sesshan, Adam Olshen
维护者:Venkatraman E. Seshan
引用(从R中,输入引用(“DNAcopy”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DNAcopy")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“DNAcopy”)
R脚本 | DNAcopy | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,微阵列,软件 |
版本 | 1.60.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 15年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | CGHcall,cghMCR,单克隆,CRImage,PureCN |
进口我 | ADaCGH2,AneuFinder,ArrayTV,冠军,cn.farms,CNAnorm,CNVrd2,contiBAIT,conumee,文案,GWASTools,联合化疗,MEDIPS,MethCP,MinimumDistance,QDNAseq,rCGH,Repitools,芝麻,snapCGH |
建议我 | beadarraySNP,cn.mops,CopyNumberPlots,fastseg,genoset |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | DNAcopy_1.60.0.tar.gz |
Windows二进制 | DNAcopy_1.60.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DNAcopy_1.60.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/DNAcopy |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ dncopy |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DNAcopy/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: