此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAshapeR.
Bioconductor版本:3.10
DNAhapeR是一个R/BioConductor包,用于DNA形状特征的超快速、高通量预测。该软件包允许预测,可视化和编码DNA形状特征的统计学习。
作者:tsuu - pei Chiu和Federico Comoglio
维护者:tsuu - pei Chiu
引用(从R中,输入引用(“DNAshapeR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" dnnashaper ")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“DNAshapeR”)
超文本标记语言 | R脚本 | DNAshapeR |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNA3DStructure,软件,StructuralPrediction |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.3 (R-3.3)(四年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.4),GenomicRanges |
进口 | Rcpp(> = 0.12.1),Biostrings,字段 |
链接 | Rcpp |
建议 | AnnotationHub,knitr,rmarkdown,testthat,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,脱字符号 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | DNAshapeR_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | DNAshapeR_1.14.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DNAshapeR_1.14.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAshapeR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DNAshapeR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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