位深蓝

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeepBlueR

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见位深蓝．

位深蓝

Bioconductor版本:3.10

通过R访问深蓝表观遗传学数据服务器。

作者:Felipe Albrecht, Markus List

维护者:菲利普·阿尔布雷希特<菲利普。albrecht at mpi- info .mpg.de>， Markus List < Markus。在wzw.tum.de列表>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DeepBlueR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“位深蓝”)

超文本标记语言	R脚本	深蓝表观基因组数据服务器- R包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，CpGIsland，DNAMethylation，DataImport，DataRepresentation，表观遗传学，GeneRegulation，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，预处理，软件，ThirdPartyClient
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 3.3),XML，RCurl
进口	GenomicRanges，data.table，stringr，diffr，dplyr、方法、rjson跑龙套,R.utils，foreach，withr，rtracklayer，GenomeInfoDb，设置，filehash
链接
建议	knitr，rmarkdown，萝拉，Gviz，gplots，ggplot2，tidyr，RColorBrewer，matrixStats
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DeepBlueR_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	DeepBlueR_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DeepBlueR_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeepBlueR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/位深蓝
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DeepBlueR/
包下载报告	下载数据