此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅表达。
生物导体版本:3.10
该软件包用于在EMBL-EBI表达地图集中搜索数据集,并将其下载到R中以进行进一步分析。每个表达式图集数据集被表示为一个简单对象,每个平台一个元素。测序数据包含在摘要的特性对象中,而微阵列数据包含在表达式集或Malist对象中。
作者:玛丽亚·基斯(Maria Keays)
维护者:Suhaib Mohammed
引用(从r内,输入引用(“表达式”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ expressiveatatlas”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“表达式”)
html | R脚本 | 表达 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | ArrayExpress,,,,实验数据,,,,表达数据,,,,微阵列,,,,序列数据,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(4年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | r(> = 3.2.0),方法,生物酶,,,,总结性特征,,,,林玛,,,,S4VECTORS,,,,XML2 |
进口 | utils,XML,,,,httr |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | pi |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | expressionAtlas_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | expressionAtlas_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ExpressionAtlas_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/expressionatlas |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/expressiveatlas |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/expressionatlas/ |
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