表达

doi:10.18129/b9.bioc.expressionatlas

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅表达

从embl-ebi表达图集下载数据集

生物导体版本:3.10

该软件包用于在EMBL-EBI表达地图集中搜索数据集,并将其下载到R中以进行进一步分析。每个表达式图集数据集被表示为一个简单对象,每个平台一个元素。测序数据包含在摘要的特性对象中,而微阵列数据包含在表达式集或Malist对象中。

作者:玛丽亚·基斯(Maria Keays)

维护者:Suhaib Mohammed

引用(从r内,输入引用(“表达式”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ expressiveatatlas”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“表达式”)

html R脚本 表达
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ArrayExpress,,,,实验数据,,,,表达数据,,,,微阵列,,,,序列数据,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4年)
执照 GPL(> = 3)
要看 r(> = 3.2.0),方法,生物酶,,,,总结性特征,,,,林玛,,,,S4VECTORS,,,,XML2
进口 utils,XML,,,,httr
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 pi
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 expressionAtlas_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 expressionAtlas_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ExpressionAtlas_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/expressionatlas
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/expressiveatlas
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/expressionatlas/
软件包下载报告 下载统计

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