GENIE3

DOI:10.18129 / B9.bioc.GENIE3

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GENIE3

树集合的基因网络推理

Bioconductor版本:3.10

这个包实现了GENIE3算法,用于从表达数据推断基因调控网络。

作者:Van Anh Huynh-Thu, Sara Aibar, Pierre Geurts

维护者:Van Anh Huynh-Thu

引文(从R内,输入引用(“GENIE3”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GENIE3")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GENIE3”)

超文本标记语言 R脚本 GENIE3
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DecisionTreeGeneExpressionGraphAndNetwork网络NetworkInference回归软件SystemsBiology
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于
进口 统计数据,reshape2
链接
建议 knitrrmarkdownforeachdoRNGdoParallelBiobaseSummarizedExperimenttestthat、方法
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 MetNetnetbenchmark
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 GENIE3_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 GENIE3_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GENIE3_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GENIE3
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GENIE3/
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