哥特
doi：10.18129/b9.bioc.gothic
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅哥特。
HI-C数据分析的二项式测试
生物导体版本：3.10
这是使用累积二项式测试的HI-C分析软件包，以检测远端基因组基因座之间的相互作用，这些远端基因组基因群的读取明显超过HI-C实验中的偶然性。它采用映射的配对NG读为输入，并回馈基因组中给定垃圾箱大小的显着相互作用的列表。
作者：Borbala Mifsud和Robert Sugar
维护者：borbala mifsud
引用（从r内，输入引用（“哥特式”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gothic”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“哥特式”）
| R脚本 | package_vignettes.pdf | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 表观遗传学，，，，嗝，，，，免疫学，，，，预处理，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（6年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），方法，基因组机，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，Data.Table |
| 进口 | 生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.9.38），iranges，，，，rsamtools，，，，Shortread，，，，rtracklayer，，，，GGPLOT2，，，，生物管理器，grdevices，utils，stats，GenomeInfodB |
| 链接 | |
| 建议 | Hicdatalymphoblast |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gothic_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gothic_1.22.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Gothic_1.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gothic |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/哥特式 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/gothic/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
