GeneExpressionSignature

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneExpressionSignature

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GeneExpressionSignature．

基于基因表达签名的相似性度量

Bioconductor版本:3.10

这个包给出了基因表达签名的实现及其与每个签名的距离。基因表达特征是表达与感兴趣的生物状态相关的基因列表。利用基于Kolmogorov-Smirnov统计量的非参数、基于秩的模式匹配策略来定义其距离。基因表达特征及其距离可用于检测药物、疾病和感兴趣的生物状态特征之间的相似性。

作者:杨曹

维护人员:曹杨< yiluheiheat gmail.com>，李飞，鹿晗

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GeneExpressionSignature")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GeneExpressionSignature”)

PDF	R脚本	GeneExpressionSignature
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression，软件
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (R-2.14)(8.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.13),Biobase，PGSEA
进口
链接
建议	apcluster，GEOquery
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GeneExpressionSignature_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	GeneExpressionSignature_1.32.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GeneExpressionSignature_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneExpressionSignature
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneExpressionSignature
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeneExpressionSignature/
包下载报告	下载数据