GenomeGraphs

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomeGraphs

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.10版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见GenomeGraphs．

绘制ensemble的基因组信息

Bioconductor版本:3.10

基因组数据分析需要已知基因组信息和新的实验数据的集成可视化。GenomeGraphs使用biomaRt包对Ensembl执行实时注释查询，并将其转换为网格图形包的视口中的基因/转录本结构。这将导致基因组信息与您的数据一起绘制。GenomeGraphs的另一个优点是可以将不同的数据类型，如阵列CGH、基因表达、测序和其他数据，一起绘制在一个图中，使用相同的基因组坐标系统。

作者:Steffen Durinck ， James Bullard < Bullard at berkeley.edu>

维护人员:Steffen Durinck

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GenomeGraphs”)

PDF	R脚本	基因组用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,软件,可视化
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.2 (R-2.7)(12年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10)，方法，biomaRt、网格
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	Genominator,waveTiling
进口我
建议我	leeBamViews,益生元,益生元
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	GenomeGraphs_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	GenomeGraphs_1.46.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GenomeGraphs_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomeGraphs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomeGraphs
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GenomeGraphs/
软件包下载报告	下载数据