Genomicozone
doi：10.18129/b9.bioc.genomicozone
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Genomicozone。
描述差异基因活性的杰出基因组区
生物导体版本：3.10
该包装将沿染色体的基因活性簇成区域，检测到差异区域为杰出区域，并可视化整个基因组中杰出区域的地图。该方法保证群集最优性，线性运行时到样本量和可重复性。它可以通过基因组重组，结构变异和表观基因组改变引起的效果的新表征。
作者：惠祖（Mingzhou）歌曲
维护者：hua zhong
引用（从r内，输入引用（“基因组”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ genomicozone”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Genomicozone”）
| html | R脚本 | Genomicozone |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，生物医学信息学，，，，细胞生物学，，，，聚类，，，，覆盖范围，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，功能基因组学，，，，功能性预测，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，遗传学，，，，基因组变量，，，，rnaseq，，，，回归，，，，测序，，，，软件，，，，结构变化，，，，系统生物学，，，，转录，，，，转录组学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月） |
| 执照 | LGPL（> = 3） |
| 要看 | r（> = 3.6），ckmeans.1d.dp（> = 4.3.0），基因组机，，，，Biomart，，，，GGPLOT2 |
| 进口 | grdevices，统计，utils，plyr，，，，栅格，，，，SJSTATS， 平行，GGBIO，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，rdpack |
| 链接 | |
| 建议 | readxl，，，，地球，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Genomicozone_1.0.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Genomicozone_1.0.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Genomicozone_1.0.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicozone |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/genomicozone |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/genomicozone/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
