检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见检查．

利用RNA-seq数据建模RNA合成、加工和降解

Bioconductor版本:3.10

INSPEcT(从转录组数据中合成、处理和降解率的推断)时间过程实验或稳态条件下的RNA-seq数据，有或没有新生RNA数据的支持。

作者:Stefano de Pretis

维护人员:Stefano de Pretis ， Mattia Furlan

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“检查”)

超文本标记语言	R脚本	从转录组数据推断合成、处理和降解率
超文本标记语言	R脚本	INSPEcT_GUI.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，RNASeq，测序，软件，SystemsBiology，TimeCourse
版本	1.16.3
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 3.5)，方法，Biobase，BiocParallel
进口	pROC，deSolve，rootSolve，KernSmooth，gdata，GenomicFeatures，GenomicRanges，IRanges，BiocGenerics，GenomicAlignments，Rsamtools，S4Vectors，GenomeInfoDb，DESeq2，plgem，SummarizedExperiment，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，闪亮的
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	INSPEcT_1.16.3.tar.gz
Windows二进制	INSPEcT_1.16.3.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	INSPEcT_1.16.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/检查
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/INSPEcT/
包下载报告	下载数据