此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见IPPD.
Bioconductor版本:3.10
该软件包提供了从原始质谱中提取同位素峰模式的功能。这是通过使用非负最小二乘或最小绝对偏差拟合将大量模板基函数拟合到原始频谱来完成的。该软件包提供了一个灵活的功能,试图以一种适合数据中的峰值形状的方式估计模型参数。该包还提供了处理LCMS运行的功能。
作者:Martin Slawski
维护者:Martin slowski
引文(从R内,输入引用(“IPPD”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("IPPD")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“IPPD”)
R脚本 | IPPD手册 | |
参考手册 |
biocViews | 蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(9年) |
许可证 | GPL(版本2或更高版本) |
取决于 | R (>= 2.12.0),质量,矩阵,XML,消化,bitops |
进口 | 方法,统计数据,图形 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | RforProteomics |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | IPPD_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | IPPD_1.34.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | IPPD_1.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IPPD |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IPPD |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/IPPD/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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