ImpulseDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImpulseDE

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ImpulseDE．

脉冲模型在时间序列数据中的DE基因检测

Bioconductor版本:3.10

impulse适合于捕获高吞吐量时间序列数据集中的单一脉冲样模式。通过对每个基因拟合一个代表性的脉冲模型，它报告了不同表达的基因，无论是在单个实验的时间点上，还是在两个实验的两个时间过程之间。为了优化运行时间，代码使用了集群步骤和多线程。

作者:Jil Sander [aut, cre]， Nir Yosef [aut]

维护者:Jil Sander < Jil。sander at uni-bonn.de>， Nir Yosef

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" impulse ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ImpulseDE”)

PDF	R脚本	ImpulseDE
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件，StatisticalMethod，TimeCourse
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	图形，grDevices, stats, utils，并行，编译器，R (>= 3.2.3)
进口	北极监测和评估方案，引导
链接
建议	纵向，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/YosefLab/ImpulseDE
BugReports	https://github.com/YosefLab/ImpulseDE/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ImpulseDE_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	ImpulseDE_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ImpulseDE_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ImpulseDE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ImpulseDE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ImpulseDE/
包下载报告	下载数据