接口

doi:10.18129/b9.bioc.junctionseq

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅接口

接口:RNA-seq数据中检测差分外显子和剪接结的用法的实用程序

生物导体版本:3.10

RNA-Seq数据中差分外显子或剪接结构使用情况检测和可视化的实用程序。

作者:Stephen Hartley [AUT,CRE](博士学位),Simon Anders [CPH],Alejandro Reyes [CPH]

维护人员:Stephen Hartley

引用(从r内,输入引用(“ innctionseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ innctionseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ innctionseq”)

PDF 接口式小插图
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 差异性,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4年)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.2.2),方法,总结性特征(> = 0.2.0),RCPP(> = 0.11.0),rcpparmadillo(> = 0.3.4.4)
进口 deseq2(> = 1.10.0),Statmod,,,,HMISC,,,,plotrix,,,,Stringr,,,,生物酶(> = 2.30.0),Locfit,,,,生物基因(> = 0.7.5),生物比较,,,,GeneFilter,,,,Geneplotter,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 大量的,,,,尼特,,,,JCTSEQDATA,,,,生物使用
系统要求
增强 开罗,,,,普里尔
URL http://hartleys.github.io/junctionseq/index.html
BugReports https://github.com/hartleys/junctionseq/issues
取决于我
进口我 途径图
建议我 JCTSEQDATA
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 inctionseq_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 inctionseq_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) inctionseq_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/junctionseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/innctionseq
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/junctionseq/
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