工商管理硕士

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBASED

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见工商管理硕士

包包含使用基于等位基因特异性表达检测的元分析ASE分析的功能

Bioconductor版本:3.10

该软件包实现了MBASED算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中单个位点(SNVs)的等位基因计数被集成到ASE的基因特异性测量中,并利用模拟适当地评估观察到的ASE的统计显著性。

作者:奥列格·梅巴,休斯顿·吉尔伯特

维护者:Oleg Mayba < Mayba。gene.com>的奥列格

引用(从R中,输入引用(mba)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MBASED")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

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文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression测序软件转录
版本 1.20.0
在Bioconductor公司 BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 RUnitBiocGenericsBiocParallelGenomicRangesSummarizedExperiment
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 MBASED_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 MBASED_1.20.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MBASED_1.20.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/MBASED
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBASED
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MBASED/
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