此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见工商管理硕士.
Bioconductor版本:3.10
该软件包实现了MBASED算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中单个位点(SNVs)的等位基因计数被集成到ASE的基因特异性测量中,并利用模拟适当地评估观察到的ASE的统计显著性。
作者:奥列格·梅巴,休斯顿·吉尔伯特
维护者:Oleg Mayba < Mayba。gene.com>的奥列格
引用(从R中,输入引用(mba)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MBASED")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes (mba)
R脚本 | 工商管理硕士 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,测序,软件,转录 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | RUnit,BiocGenerics,BiocParallel,GenomicRanges,SummarizedExperiment |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | MBASED_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | MBASED_1.20.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MBASED_1.20.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/MBASED |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBASED |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MBASED/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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