此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅mbttest。
生物导体版本:3.10
MBTTEST方法是从Baggerly等(2003)的Beta t检验方法开发的。与Bayseq(Hard Castle and Kelly 2010),Deseq(Anders and Huber 2010)和精确测试相比(Robinson and Smyth 2007,2008)和McCarthy等人的GLM(2012),MBTTEST具有很高的工作效率,即,即,即它具有高功率,FDR估计的高保守性和高稳定性。MBTTEST适合转录组合数据,标签数据,SAGE数据(计数数据)或一些重复的库。它可用于鉴定两个条件之间差异表达的基因,mRNA同工型或标签。
作者:Yuan-de tan
维护者:yuan-de tan
引用(从r内,输入引用(“ mbttest”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mbttest”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ mbttest”)
R脚本 | 用“ mbttest”软件包分析RNA-Seq计数数据 | |
mbttest-manual.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,覆盖范围,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,多重组合,,,,智者,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(4年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3.0),统计,GPLOTS,,,,gtools,图形,基础,utils,grdevices |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mbttest_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | mbttest_1.14.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | mbttest_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbttest |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mbttest |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/mbttest/ |
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