MergeMaid

DOI:10.18129 / B9.bioc.MergeMaid

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MergeMaid

合并女仆

Bioconductor版本:3.10

在这个R扩展的功能是为了基因表达阵列数据的交叉研究比较。用户需要的是基因表达矩阵,它们对应的基因id向量和其他有用的信息,它们可以是'list','matrix'或'ExpressionSet'。主要功能是“mergeExprs”,它将输入对象转换为合并格式的数据,这样就可以很容易地找到不同数据集中的共同基因。用函数incor计算相关系数。其他函数使用'modelOutcome'的输出图形化地显示结果,并交叉验证基因表达数据与生存率的关联。

作者:钟小刚< Zhong at ams.jhu.edu> Leslie Cope < Cope at jhu.edu> Elizabeth Garrett Giovanni Parmigiani

维护人员:钟晓刚<钟晓刚at ams.jhu.edu>

引文(从R内,输入引用(“MergeMaid”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MergeMaid”)

PDF MergeMaid底漆
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression微阵列软件可视化
版本 2.58.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10.0),生存Biobase质量、方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://astor.som.jhmi.edu/MergeMaid
全靠我
进口我 CrossICCmetaArrayXDE
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 MergeMaid_2.58.0.tar.gz
Windows二进制 MergeMaid_2.58.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MergeMaid_2.58.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MergeMaid
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MergeMaid
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MergeMaid/
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