此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MergeMaid.
Bioconductor版本:3.10
在这个R扩展的功能是为了基因表达阵列数据的交叉研究比较。用户需要的是基因表达矩阵,它们对应的基因id向量和其他有用的信息,它们可以是'list','matrix'或'ExpressionSet'。主要功能是“mergeExprs”,它将输入对象转换为合并格式的数据,这样就可以很容易地找到不同数据集中的共同基因。用函数incor计算相关系数。其他函数使用'modelOutcome'的输出图形化地显示结果,并交叉验证基因表达数据与生存率的关联。
作者:钟小刚< Zhong at ams.jhu.edu> Leslie Cope < Cope at jhu.edu> Elizabeth Garrett
维护人员:钟晓刚<钟晓刚at ams.jhu.edu>
引文(从R内,输入引用(“MergeMaid”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MergeMaid”)
MergeMaid底漆 | ||
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 2.58.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.10.0),生存,Biobase,质量、方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://astor.som.jhmi.edu/MergeMaid |
全靠我 | |
进口我 | CrossICC,metaArray,XDE |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MergeMaid_2.58.0.tar.gz |
Windows二进制 | MergeMaid_2.58.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MergeMaid_2.58.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MergeMaid |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MergeMaid |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MergeMaid/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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