动机

doi:10.18129/b9.bioc.motiv

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅动机

主题识别和验证

生物导体版本:3.10

该软件包利用邮票将一组图案与给定数据库(例如Jaspar)进行比较。它也可以用于可视化基序,主题分布,模块和滤波器图案。

作者:Eloi Mercier,Raphael Gottardo

维护者:bcgsc.ca>的Eloi Mercier

引用(从r内,输入引用(“动机”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ motiad”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“动态”)

PDF R脚本 动机用户指南
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,芯片,,,,基因组序列,,,,微阵列,,,,图案,,,,软件
版本 1.42.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(10年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 2.10),图形,生物基因,,,,基因组机
进口 方法,统计,网格,S4VECTORS,,,,iranges(> = 1.13.5),生物弦,,,,格子,,,,rgadem,UTILS
链接
建议 rtracklayer
系统要求 GNU科学库> = 1.6(http://www.gnu.org/software/gsl/)
增强
URL
取决于我 Motifstack
进口我 tcgaworkflow
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Motiv_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 MOTIOD_1.42.0.ZIP(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) MOTIOD_1.42.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motiv
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/动机
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/motiv/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户