此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅动机。
生物导体版本:3.10
该软件包利用邮票将一组图案与给定数据库(例如Jaspar)进行比较。它也可以用于可视化基序,主题分布,模块和滤波器图案。
作者:Eloi Mercier,Raphael Gottardo
维护者:bcgsc.ca>的Eloi Mercier
引用(从r内,输入引用(“动机”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ motiad”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“动态”)
R脚本 | 动机用户指南 | |
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,芯片,,,,基因组序列,,,,微阵列,,,,图案,,,,软件 |
版本 | 1.42.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.6(R-2.11)(10年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 2.10),图形,生物基因,,,,基因组机 |
进口 | 方法,统计,网格,S4VECTORS,,,,iranges(> = 1.13.5),生物弦,,,,格子,,,,rgadem,UTILS |
链接 | |
建议 | rtracklayer |
系统要求 | GNU科学库> = 1.6(http://www.gnu.org/software/gsl/) |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Motifstack |
进口我 | tcgaworkflow |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Motiv_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | MOTIOD_1.42.0.ZIP(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | MOTIOD_1.42.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motiv |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/动机 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/motiv/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |