此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅PAA。
生物导体版本:3.10
PAA导入已保存在GPR文件格式的单色(蛋白质)微阵列数据-ESP。原始阵列数据。预处理后(背景校正,批处理过滤,归一化)单变量特征预选(例如,使用“最小M统计”方法 - 以下简称为“ MMS”)。随后,进行了多元特征选择以发现生物标志物候选物。因此,可以使用基于频率的向后消除侵犯或合奏特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱,其中包括几个不同的图,用于检查和评估。
作者:Michael Turewicz [AUT,CRE],Martin Eisenacher [CTB,CRE]
维护者:Michael Turewicz
引用(从r内,输入引用(“ PAA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ paa”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ PAA”)
R脚本 | PAA教程 | |
paa_1.7.1.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 分类,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,蛋白质组学,,,,软件 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年) |
执照 | bsd_3_clause +文件执照 |
要看 | r(> = 3.2.0),RCPP(> = 0.11.6) |
进口 | E1071,,,,GPLOTS,,,,gtools,,,,林玛,,,,大量的,,,,Mrmre,,,,Randomforest,,,,rocr,,,,SVA |
链接 | RCPP |
建议 | 生物使用,,,,运行,,,,生物基因,,,,VSN |
系统要求 | C ++软件包随机丛林 |
增强 | |
URL | http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/paa/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | paa_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | PAA_1.20.0.ZIP |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | paa_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/paa |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/paa |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/paa/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |