PAA

doi:10.18129/b9.bioc.paa

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅PAA

PAA(蛋白质阵列分析仪)

生物导体版本:3.10

PAA导入已保存在GPR文件格式的单色(蛋白质)微阵列数据-ESP。原始阵列数据。预处理后(背景校正,批处理过滤,归一化)单变量特征预选(例如,使用“最小M统计”方法 - 以下简称为“ MMS”)。随后,进行了多元特征选择以发现生物标志物候选物。因此,可以使用基于频率的向后消除侵犯或合奏特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱,其中包括几个不同的图,用于检查和评估。

作者:Michael Turewicz [AUT,CRE],Martin Eisenacher [CTB,CRE]

维护者:Michael Turewicz ,Martin Eisenacher

引用(从r内,输入引用(“ PAA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ paa”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PAA”)

PDF R脚本 PAA教程
PDF paa_1.7.1.pdf
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 分类,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年)
执照 bsd_3_clause +文件执照
要看 r(> = 3.2.0),RCPP(> = 0.11.6)
进口 E1071,,,,GPLOTS,,,,gtools,,,,林玛,,,,大量的,,,,Mrmre,,,,Randomforest,,,,rocr,,,,SVA
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,运行,,,,生物基因,,,,VSN
系统要求 C ++软件包随机丛林
增强
URL http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/paa/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 paa_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 PAA_1.20.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) paa_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/paa
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/paa
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/paa/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户