此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PAIRADISE。
Bioconductor版本:3.10
该软件包实现了PAIRADISE程序,用于检测配对RNA-Seq数据中匹配复制之间的差异异构体表达。
作者:Levon Demirdjian,吴颖年,邢毅
维护者:强胡<强。Hu在roswellpark.org>, Levon Demirdjian
引文(从R内,输入引用(“PAIRADISE”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PAIRADISE")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“PAIRADISE”)
超文本标记语言 | R脚本 | PAIRADISE |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(1年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.6),nloptr |
进口 | SummarizedExperiment,S4Vectors,统计,方法,abind,BiocParallel |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | PAIRADISE_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | PAIRADISE_1.2.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | PAIRADISE_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAIRADISE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PAIRADISE |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PAIRADISE/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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