Papi

DOI：10.18129 / b9.bioc.papi.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Papi。

基于代谢组数据预测代谢途径活动

生物导体版本：3.10

探测器 - Papi - 是一种用于预测基于代谢途径的活性的R包，其基于含有代谢物列表的代谢组数据集及其各自的不同生物样品的各自丰富。Papi产生了提高最终生物解释的假设。见Aggio，R.B.M;Ruggiero，K.和Villas-Boas，S.G.（2010） - 途径活动分析（PAPI）：从代谢物概况到代谢途径活动。生物信息学。

作者：Raphael Aggio

维护者：Raphael Aggio

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“papi”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Papi”）

PDF.	r script.	应用papi
PDF.		papi.pdf.
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	免疫学那质谱那代谢组学那软件
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（7年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 2.15.2），svdialogs.那凯格斯特
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	papi_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	papi_1.26.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	papi_1.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/papi.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包裹/ papi
包短网址	https://biocumon.org/packages/papi/
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