此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PCAN.
Bioconductor版本:3.10
基于通路共识方法的表型比较。基于与候选基因相关的附加基因(例如通路或网络邻居),评估候选基因与一组表型之间的关系。
作者:马修·佩奇和帕特里斯·戈达尔
维护者:Matthew Page < Matthew。>和Patrice Godard < Patrice。戈达尔在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“PCAN”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PCAN")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“PCAN”)
超文本标记语言 | R脚本 | 评估一组表型的基因相关性 |
参考手册 |
biocViews | 注释,FunctionalPrediction,遗传学,网络,通路,测序,软件,VariantAnnotation |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(4年) |
许可证 | Cc by nc - nd 4.0 |
取决于 | R (>= 3.3),BiocParallel |
进口 | grDevices,统计数据 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,reactome.db,STRINGdb |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | PCAN_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | PCAN_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | PCAN_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PCAN |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PCAN |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PCAN/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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