PGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PGSEA

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见PGSEA。

参数化基因集富集分析

Bioconductor版本:3.10

基因集富集的参数分析

作者:Kyle Furge < Kyle。furge在vai.org>和Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>

维护者:Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PGSEA")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“PGSEA”)

PDF	R脚本	HOWTO: PGSEA
PDF	R脚本	如何:PGSEA示例工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，软件
版本	1.60.0
在Bioconductor中	BioC 2.0 (R-2.5)(13年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.10)，GO.db，KEGG.db，AnnotationDbi，annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议	GSEABase，GEOquery，org.Hs.eg.db，hgu95av2.db，limma
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	GeneExpressionSignature
进口我
建议我	gskb
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	PGSEA_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	PGSEA_1.60.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	PGSEA_1.60.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/PGSEA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PGSEA/
软件包下载报告	下载数据