Rcwl

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rcwl

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Rcwl．

使用CWL包装命令工具和管道

Bioconductor版本:3.10

该包可以是一种简单且用户友好的方式，用于使用公共工作流语言(Common Workflow Language, CWL)在R中管理命令行工具和构建数据分析管道。

作者:胡强[aut, cre]，刘谦[aut]

维护者:Qiang Hu < Qiang。胡在roswellpark.org >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Rcwl")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Rcwl”)

超文本标记语言	R脚本	Rcwl用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ImmunoOncology，软件，WorkflowStep
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(1年)
许可证	GPL-2 |文件许可证
取决于	R (> = 3.6),yaml、方法、S4Vectors
进口	跑龙套,统计数据,BiocParallel，batchtools，图，闪亮的，R.utils，codetools
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements	Python (>= 2.7)， cwltool (>= 1.0.2018)
增强了
URL
取决于我	RcwlPipelines
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Rcwl_1.2.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Rcwl_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rcwl
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rcwl
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Rcwl/
包下载报告	下载数据