repviz
doi：10.18129/b9.bioc.repviz
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅repviz。
基因组区域的复制定向可视化
生物导体版本：3.10
repviz以简单有效的方式使基因组区域的视图。REPVIZ允许同时查看研究条件的测序计数中的内部和组间变化，及其与用户选择的数据分析方法的输出功能（例如确定的峰）进行比较。REPVIZ工具主要是为染色质数据设计的，例如作为chip-seq和atac-seq，但也可以与其他测序数据（例如RNA-SEQ）或不同类型的基因组数据组合一起使用。
作者：Thomas Faux，KalleRytkönen，Asta Laiho，Laura L. Elo
维护者：thomas faux，at asta laiho
引用（从r内，输入引用（“ repviz”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ repviz”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ repviz”）
| html | R脚本 | repviz |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | Atacseq，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，可视化，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.1），基因组机（> = 1.30.0），rsamtools（> = 1.34.1），iranges（> = 2.14.0），Biomart（> = 2.36.0），S4VECTORS（> = 0.18.0），图形，grdevices，utils |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | repviz_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | repviz_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | repviz_1.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/repviz |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/repviz |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/repviz/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
