林戈

doi:10.18129/b9.bioc.ringo

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅林戈

R调查芯片芯片寡聚架

生物导体版本:3.10

包装铃声促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是数据读数,质量评估,数据可视化和基因组区域的识别,显示了CHIP-CHIP中的富集。该软件包具有处理芯片芯片项目中使用的Nimblegen的两色寡核苷酸微阵列的功能,但鉴于数据以RGLIST(RGLIST(RAW)或expressionset(pre-pre-pre-predionset)提供(pre-pre-prectionset)(pre-chip-chip数据分析)(pre-chip-chip数据分析)(处理)。该软件包采用了来自生物导体项目的其他各种软件包的功能,并提供了其他芯片芯片特异性和敏捷特异性功能。

作者:Joern Toedling,Oleg Sklyar,Tammo Krueger,Matt Ritchie,Wolfgang Huber

维护者:J。Toedling

引用(从r内,输入引用(“林戈”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ringo”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ringo”)

PDF R脚本 r对敏捷寡聚的调查
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DataImport,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道
版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(13年)
执照 艺术2.0
要看 方法,生物酶(> = 1.14.1),rcolorbrewer,,,,林玛,,,,矩阵, 网格,格子
进口 生物基因(> = 0.1.11),GeneFilter,,,,林玛,,,,VSN,Stats4
链接
建议 rtracklayer(> = 1.3.1),mclust,,,,topgo(> = 1.15.0)
系统要求
增强
URL
取决于我 CCTORIAL,,,,simbindprofiles,,,,斯塔尔
进口我 repitools
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ringo_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 ringo_1.50.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) ringo_1.50.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ringo
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/林戈
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ringo/
软件包下载报告 下载统计

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