Rmagpie

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rmagpie

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见Rmagpie

基于MicroArray基因表达的程序误差率估计

Bioconductor版本:3.10

微阵列分类是为生物学家和统计学家设计的。它提供了在标记微阵列数据集上训练分类器的能力,然后使用该分类器来预测新观测的类别。一系列现代分类器是可用的,包括支持向量机(svm),最近收缩质心(NSCs)…提供了先进的方法来估计预测错误率,并报告在区分类中出现的必要基因子集。

作者:Camille Maumet ,由C. Ambroise J. Zhu贡献

维护者:Camille Maumet

引文(从R内,输入引用(“Rmagpie”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Rmagpie")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“Rmagpie”)

PDF R脚本 Rmagpie例子
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类微阵列软件
版本 1.42.0
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(11年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 2.6.1),Biobase(> = 2.5.5)
进口 Biobase(> = 2.5.5),e1071,图形,grDevices,kernlab、方法、pamr,统计,效用
链接
建议 xtable
SystemRequirements
增强了
URL //www.andersvercelli.com/
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 Rmagpie_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 Rmagpie_1.42.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Rmagpie_1.42.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rmagpie
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rmagpie
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Rmagpie/
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